На один виток спирали приходится 3,6 остатка аминокислот. Радикалы аминокислот располагаются снаружи спирали.

Формирование a-спирали может быть нарушено:

В участках, содержащих пролин.

Пролин не содержит атома H, способного образовывать водородную связь. В этом месте полипептидной цепи возникает изгиб или петля;

Если последовательно расположены несколько одноименно заряженных радикалов, между которыми возникает электростатическое отталкивание;

Участки с близкорасположенными объемными радикалами (триптофан, метионин, гистидин).

2) b-структура образуется между линейными областями одной полипептидной цепи или между разными полипептидными цепями:

Параллельная b-структура:

Антипараллельная b-структура:

3) Беспорядочный клубок – это области с нерегулярной вторичной структурой.

Это петлеобразные и кольцеобразные стр-ры, с меньшей регулярностью укладки, чем a-спираль и b-стр-ра.