Распределение генотипов cagA, vacA, iceA и babA2 H.pylori в Москве и Московской области

В Москве и Московской области VacAs1 генотип H.pylori был верифицирован в 63% случаев при изучении биопсийного материала и в 77% случаев при изучении клинических изолятов H.pylori. 18 штаммов H.pylori, верифицированных в биопсийном материале, и 2 клинических изолята H.pylori имели генотип vacAs2. Интересно, что штаммы H.pylori, имеющие смешанный генотип vacA (s1/s2 или m1/m2), указывающий на присутствие более чем одного штамма H.pylori, были верифицированы в биопсийном материале в 44 (50%) случаях и в 4-х клинических изолятах

H.pylori (30%).

«Helicobacter pylori - инфекция» 17

При исследовании биопсийного материала в 81 (93%) случае нами был зарегистрирован маркер островка патогенности H.pylori, который в 100% случаев присутствовал и в клинических изолятах H.pylori. К сожалению, нам не удалось выявить, как отдельный, iceA2 генотип ни в биопсийном материале, ни в клинических изолятах. IceA2 генотип выявлялся только в сочетании с iceA1 генотипом в 18 (21%) образцах биопсий и в 5 (38%) клинических изолятах H.pylori. IceA1 генотип был зафиксирован в 52 образцах биопсий и 6 клинических изолятах H.pylori. IceA генотип не был выявлен в 17 (20%) биопсий и у 2 (15%) клинических изолятов H.pylori. BabA2 ген верифицирован у H.pylori при исследовании биопсийного материала в 34 (39%) случаях. Этот же ген присутствовал в 8 (62%) клинических изолятах H.pylori.

Нами также были выявлены комбинации vacA s- и m- регионов, cagA, iceA и babA2 генотипов H.pylori. Из 18 возможных генотипов H.pylori vacS1, cagA, iceA1 и babA2 генотип встречался в 31% случаев у H.pylori верифицированного в биопсийном материале, и у 54% клинических изолятов H.pylori. Ни одного образца с генотипом vacAs2/m1нами найдено не было.Неслучайный характер распределения комбинаций генотипов подтверждаетсяассоциацией отдельных, индивидуальных генотипов cagA, vacA, iceA и babA. СagA положительные H.pylori в биопсиях и клинических изолятах чаще всего имели vacAs1 (p<0.001) и iceA1 (p<0.001) генотипы.

Как видно из данных, представленных в Таблице результаты генотипирования генов патогенности у H.pylori, верифицированного в биопсийном материале и в клинических изолятах, значительно различаются, особенно для vacAm1, babA2 генотипов.

Тем не менее, на имеющемся биологическом материале (биопсии, клинические изоляты) возможно оценить достоверность результатов, полученных при генотипировании H.pylori в биопсиях по отношению к клиническим изолятам (стандарт генотипирования). Так для vacA, cagA и iceA ошибка определения генотипа в биопсиях по сравнению с культурами составляет 10-15%, а для babA2 20-25%. Результаты генотипирования в биопсиях несколько занижены по отношению к культурам, что вероятно связано с сохранностью ДНК H.pylori (некоторая часть ПЦР анализа ДНК из биопсий производилась ретроспективно).